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RNA-seqデータ解析（２群間比較, Strand-specific, Single-end）

RNA-seq TopHat Cufflinks Cuffdiff edgeR Tutorial

概要 RNA-seqのデータを用いて、siRNAによるノックダウンや特定の刺激により発現量が変動したRNA群を同定する方法（2群間のデータの比較）を紹介します。 ここでは、データのダウンロード方法からLinuxを用いたデータ解析まで、RNA-seqのデータ解析の詳細をS…

RNA-seqデータ解析（２群間比較, Unstranded, Single-end）

NGS RNA-seq Tutorial TopHat Cufflinks Cuffdiff edgeR

概要 RNA-seqのデータを用いて、siRNAによるノックダウンや特定の刺激により発現量が変動したRNA群を同定する方法（2群間のデータの比較）を紹介します。 ここでは、データのダウンロード方法からLinuxを用いたデータ解析まで、RNA-seqのデータ解析の詳細をS…